Analisis Multiple Alignment pada Penyebaran Covid-19 Varian E.G.5 dengan Metode Maximum Likelihood

Abstract

Salah satu metode yang dapat digunakan untuk mengkonstruksi pohon filogenetik adalah maximum likelihood method. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui bagaimana mengidentifikasi suatu penyebaran virus covid varian E.G.5 menggunakan metode maximum likelihood. Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidemi Covid-19 E.G.5 berasal dari Jakarta Selatan (EPI_ISL_17664319) dan dari analisis pohon filogenetik dengan maximum likelihood diketahui ada 16 klad dengan 6 klad besar pada kluster penyebaran virus covid-19 varian E.G.5.